Wenn Ihre Distribution das aktuelle TeXLive 2012 enthält (zum Beispiel als Debian-Test), können Sie eine vollständige Installation mit den offiziellen Paketen durchführen und alle texlive entfernen Pakete und führen Sie eine Neuinstallation in /usr/local durch Befolgen Sie eine der Optionen, die auf der Website der TeX Users Group erklärt werden, da diese TeX-Pakete über ihren eigenen Paket- und Konfigurationsmanager (tlmgr ) statt apt-get oder den Paketmanager Ihrer Distribution (rpm , etc).
Wenn Ihre Distribution noch eine veraltete Version hat, wie wahrscheinlich TeXLive 2009 in Ubuntu, ohne tlmgr , ist besser die zweite Option, da es erhebliche Änderungen und Verbesserungen gibt. (Einige interessante Beispiele, die Sie auf dieser Seite finden, können mit dieser Version nicht kompiliert werden).
Das Mischen von Dateien mit denen einer MiKTeX-Installation kann zu Problemen führen. Wie in dieser Antwort gesagt, installieren Sie zusätzliche Pakete lokal (~/texmf ), immer gemäß der Readme-Datei, und wenn Sie beispielsweise in CTAN nachgesehen haben, dass das Paket nicht in TeXLive ist und Sie es daher nicht mit dem Paketmanager von Linux installieren können (als apt-get ) oder TeXLive (tlmgr ).
Um es kurz zu sagen:Tu es nicht!
TeXLive und MiKTeX sind unterschiedliche TeX-Distributionen mit eigenem, unterschiedlichem Paketmanager. Installieren Sie also beide Distributionen mit ihrem Installationsprogramm. Zum Beispiel verwendet TeXLive Pearl, das MikTeX nicht auf die gleiche Weise verwenden kann ...
Wenn Sie spezielle Pakete auf beiden Distributionen verwenden möchten, können Sie einen lokalen texmf-Baum erstellen, die Pakete (nach den Readme-Dateien) in Ihrem lokalen texmf-Baum installieren und diesen lokalen texmf-Baum in beiden Distributionen verwenden.