deine Konfiguration sagt:rotiere 2
Das bedeutet, dass Protokolldateien vor dem Entfernen zweimal rotiert werden, sodass sich logrotate nur um 2 Dateien kümmert.
Ich vermute, dass die Konfiguration irgendwann geändert wurde, weil vorher mehr Protokolldateien aufbewahrt wurden, vielleicht war es so etwas wie Rotieren 28. Diese älteren Dateien müssen Sie manuell entfernen.