Da Sie nach Best Practices gefragt haben:Das Beste ist, keine Software zu installieren, die sich nicht in den Repositories befindet. Wenn dies nicht möglich ist, besteht die beste Vorgehensweise darin, Pakete daraus zu erstellen und den Paketmanager des Systems zu verwenden, um sie zu verwalten.
Sie müssen einen Weg finden, um nach wichtigen Updates zu suchen, aber wie Sie das tun, liegt bei Ihnen. Aber wenn sie da sind, müssen Sie erneut bauen und von den neuen Paketen aktualisieren.
Haben Sie checkinstall versucht (es befindet sich in den Debian-Repositorys)?
Anstatt make install zu verwenden Sie können checkinstall verwenden und es wird ein Paket mit der Software erstellen (und installieren), sodass Sie es mit Ihrem Paketmanager verfolgen können.