Ja, das ist eine eingebaute Funktion von PulseAudio. Diverse PA-kompatible "Lautstärkemischer" wie zB pavucontrol oder ponymix können Sie jedem Programm einen anderen Ausgang zuweisen (vorausgesetzt, PA erkennt diese Ausgänge tatsächlich als separat).
Probieren Sie Ear Candy aus. Es ist nicht nur möglich, zwischen Ausgängen zu wechseln, wenn sie angeschlossen sind, sondern auch mehrere Programme nach Belieben auf andere Ausgänge zu routen (und viele andere kleine Verbesserungen).