Verwenden Sie den Befehl find, aber schließen Sie Dateien in zwei Verzeichnissen aus

Hier ist eine Möglichkeit, wie Sie es tun könnten ...

find . -type f -name "*_peaks.bed" | egrep -v "^(./tmp/|./scripts/)"

Für mich hat diese Lösung bei einer Befehlsausführung mit find nicht funktioniert, ich weiß nicht wirklich warum, also ist meine Lösung

find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;

Erklärung: dasselbe wie sampson-chen one mit den Zusätzen von

-prune - Ignoriere den fortschreitenden Pfad von ...

-o - Dann, wenn keine Übereinstimmung, die Ergebnisse drucken (die Verzeichnisse bereinigen und die verbleibenden Ergebnisse drucken)

18:12 $ mkdir a b c d e
18:13 $ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
18:13 $ find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;

gzip: . is a directory -- ignored
gzip: ./a is a directory -- ignored
gzip: ./b is a directory -- ignored
gzip: ./c is a directory -- ignored
./c/3:    0.0% -- replaced with ./c/3.gz
gzip: ./d is a directory -- ignored
./d/4:    0.0% -- replaced with ./d/4.gz
gzip: ./e is a directory -- ignored
./e/5:    0.0% -- replaced with ./e/5.gz
./e/a:    0.0% -- replaced with ./e/a.gz
./e/b:    0.0% -- replaced with ./e/b.gz

So können Sie das mit find spezifizieren :

find . -type f -name "*_peaks.bed" ! -path "./tmp/*" ! -path "./scripts/*"

Erklärung:

• find . - Suche vom aktuellen Arbeitsverzeichnis starten (standardmäßig rekursiv)
• -type f - Geben Sie find an dass Sie nur Dateien in den Ergebnissen haben möchten
• -name "*_peaks.bed" - Suchen Sie nach Dateien, deren Name auf _peaks.bed endet
• ! -path "./tmp/*" - Alle Ergebnisse ausschließen, deren Pfad mit ./tmp/ beginnt
• ! -path "./scripts/*" - Schließen Sie auch alle Ergebnisse aus, deren Pfad mit ./scripts/ beginnt

Testen der Lösung:

$ mkdir a b c d e
$ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
$ find . -type f ! -path "./a/*" ! -path "./b/*"

./d/4
./c/3
./e/a
./e/b
./e/5

Du warst ziemlich nah dran, der -name Option berücksichtigt nur den Basisnamen, wo als -path berücksichtigt den gesamten Pfad =)

Verwenden Sie

find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o  -name "*_peaks.bed" -print

oder

find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -false -o  -name "*_peaks.bed"

oder

find \( -path "./tmp" -path "./scripts" \) ! -prune -o  -name "*_peaks.bed"

Die Reihenfolge ist wichtig. Es wird von links nach rechts ausgewertet. Beginnen Sie immer mit dem Pfadausschluss.

Erklärung

Verwenden Sie nicht -not (oder ! ), um das gesamte Verzeichnis auszuschließen. Verwenden Sie -prune .Wie im Handbuch erklärt:

−prune    The primary shall always evaluate as  true;  it
          shall  cause  find  not  to descend the current
          pathname if it is a directory.  If  the  −depth
          primary  is specified, the −prune primary shall
          have no effect.

und im GNU find Handbuch:

-path pattern
              [...]
              To ignore  a  whole
              directory  tree,  use  -prune rather than checking
              every file in the tree.

In der Tat, wenn Sie -not -path "./pathname" verwenden ,find wertet den Ausdruck für jeden Knoten unter "./pathname" aus .

Suchausdrücke sind nur Bedingungsauswertungen.

• \( \) - Gruppenoperation (Sie können -path "./tmp" -prune -o -path "./scripts" -prune -o verwenden , aber es ist ausführlicher).
• -path "./script" -prune - wenn -path true zurückgibt und ein Verzeichnis ist, geben Sie true für dieses Verzeichnis zurück und nicht steige hinein.
• -path "./script" ! -prune - wird als (-path "./script") AND (! -prune) ausgewertet . Es kehrt das „immer wahr“ von Prune in immer falsch zurück. Es vermeidet das Drucken von "./script" als Streichholz.
• -path "./script" -prune -false - seit -prune gibt immer true zurück, Sie können es mit -false verfolgen dasselbe zu tun wie ! .
• -o - ODER-Operator. Wenn zwischen zwei Ausdrücken kein Operator angegeben ist, wird standardmäßig der AND-Operator verwendet.

Daher \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o -name "*_peaks.bed" -print wird erweitert zu:

[ (-path "./tmp" OR -path "./script") AND -prune ] OR ( -name "*_peaks.bed" AND print )

Der Druck ist hier wichtig, da er ohne expandiert wird zu:

{ [ (-path "./tmp" OR -path "./script" )  AND -prune ]  OR (-name "*_peaks.bed" ) } AND print

-print wird von find hinzugefügt - deshalb müssen Sie es meistens nicht in Ihrem Ausdruck hinzufügen. Und seit -prune true zurückgibt, werden "./script" und "./tmp" ausgegeben.

Bei den anderen ist es nicht nötig, da wir -prune umgestellt haben um immer falsch zurückzugeben.

Hinweis:Sie können find -D opt expr 2>&1 1>/dev/null verwenden um zu sehen, wie es optimiert und erweitert wird,
find -D search expr 2>&1 1>/dev/null um zu sehen, welcher Pfad überprüft wird.